Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLR3DP05423 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3DP05423 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms