Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTNP04004 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VTNP04004 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTNP04004 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTNP04004 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTNP04004 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTNP04004 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTNP04004 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTNP04004 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms