Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP1P03956 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP1P03956 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP1P03956 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP1P03956 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP1P03956 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP1P03956 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP1P03956 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP1P03956 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP1P03956 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP1P03956 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms