Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGAP02671 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGAP02671 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGAP02671 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGAP02671 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGAP02671 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGAP02671 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGAP02671 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGAP02671 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGAP02671 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGAP02671 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGAP02671 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FGAP02671 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGAP02671 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FGAP02671 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGAP02671 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGAP02671 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGAP02671 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGAP02671 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms