Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DRAP01903 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DRAP01903 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms