Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNB1P01574 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNB1P01574 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms