Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA3O96018 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA3O96018 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA3O96018 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA3O96018 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APBA3O96018 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APBA3O96018 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APBA3O96018 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA3O96018 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA3O96018 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA3O96018 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APBA3O96018 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APBA3O96018 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APBA3O96018 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APBA3O96018 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APBA3O96018 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA3O96018 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA3O96018 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA3O96018 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA3O96018 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APBA3O96018 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APBA3O96018 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms