Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TOP3BO95985 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOP3BO95985 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TOP3BO95985 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms