Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TNFRSF6BO95407 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF6BO95407 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms