Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE8BO95263 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE8BO95263 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms