Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG2O94898 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG2O94898 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms