Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFASCO94856 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFASCO94856 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFASCO94856 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFASCO94856 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFASCO94856 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFASCO94856 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFASCO94856 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFASCO94856 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFASCO94856 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFASCO94856 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFASCO94856 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFASCO94856 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFASCO94856 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms