Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PECR-206ENST00000474093 585 ntTSL 215.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MICALL1-202ENST00000402631 2734 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PECR-202ENST00000442122 1100 ntTSL 215.02■□□□□ -01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MICAL1-204ENST00000433205 754 ntTSL 515.02■□□□□ -01e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMPRSS4-202ENST00000517483 2074 ntTSL 214.99□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-202ENST00000561725 2738 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARF1-209ENST00000576012 3292 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF671-205ENST00000600125 2903 ntTSL 514.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RBM28-203ENST00000459726 728 ntTSL 314.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PELI2-202ENST00000559044 774 ntTSL 414.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-205ENST00000587318 704 ntTSL 214.95□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FRS2-204ENST00000548154 597 ntTSL 214.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SIDT2-216ENST00000531353 583 ntTSL 514.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-208ENST00000496852 1662 ntTSL 214.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MAP2K7-207ENST00000494348 724 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NUDT1-208ENST00000471348 263 ntTSL 314.88□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNF167-216ENST00000576965 599 ntTSL 514.85□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GS1-124K5.4-202ENST00000452565 454 ntTSL 214.85□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DLG3-205ENST00000463252 4626 ntTSL 514.83□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GRM7-202ENST00000389335 3020 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GRM7-206ENST00000440923 3088 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOK4-203ENST00000561918 908 ntTSL 314.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PPP1R16B-204ENST00000468265 299 ntTSL 314.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOK4-213ENST00000567276 546 ntTSL 414.8□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GLB1-209ENST00000450835 540 ntTSL 414.78□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SRGAP2-207ENST00000604010 884 ntTSL 514.74□□□□□ -0.052e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TRIP10-209ENST00000598843 469 ntTSL 214.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MICALL1-205ENST00000454685 1108 ntTSL 514.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNF167-206ENST00000572382 989 ntTSL 214.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AREL1-202ENST00000469797 2196 ntTSL 514.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 314.64□□□□□ -0.072e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MST1R-211ENST00000493535 1626 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 172.3
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SF3B1O75533 FRS2-203ENST00000547414 521 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 172.3
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SF3B1O75533 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOK4-207ENST00000564378 580 ntTSL 414.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
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SF3B1O75533 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MYLK3-203ENST00000562104 562 ntTSL 414.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BAP1-203ENST00000466093 1127 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 POLG-211ENST00000532584 708 ntTSL 314.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKFY1-203ENST00000570934 1881 ntTSL 514.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TCEA2-211ENST00000470559 296 ntTSL 514.52□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ACAD10-206ENST00000504803 1674 ntTSL 514.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-207ENST00000461199 803 ntTSL 514.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MFN2-206ENST00000497302 645 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TTC38-204ENST00000422713 828 ntTSL 514.47□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LMCD1-AS1-205ENST00000452802 1387 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-207ENST00000488753 796 ntTSL 314.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DRC3-206ENST00000490517 5805 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CENPF-205ENST00000495259 345 ntTSL 314.39□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMEM184B-206ENST00000457534 555 ntTSL 514.39□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 514.31□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DNAJC17-211ENST00000561110 529 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GABBR1-218ENST00000491829 4212 ntTSL 514.26□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 514.26□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 WDR59-216ENST00000569183 949 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXO24-207ENST00000474649 1330 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TRAP1-208ENST00000573872 656 ntTSL 314.24□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ESYT1-210ENST00000551790 540 ntTSL 414.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 172.3
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