Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP12O75317 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP12O75317 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP12O75317 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP12O75317 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP12O75317 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP12O75317 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP12O75317 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP12O75317 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP12O75317 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP12O75317 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP12O75317 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP12O75317 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP12O75317 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms