Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIN3BO75182 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIN3BO75182 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms