Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ABCC9O60706 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ABCC9O60706 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms