Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNT2O60583 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNT2O60583 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNT2O60583 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNT2O60583 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNT2O60583 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNT2O60583 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms