Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD2O60548 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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