Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL4O60488 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL4O60488 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms