Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLIN1O60240 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN1O60240 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms