Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL13O43927 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL13O43927 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms