Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYO1BO43795 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYO1BO43795 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYO1BO43795 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYO1BO43795 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms