Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYTH3O43739 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms