Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DENRO43583 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DENRO43583 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DENRO43583 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DENRO43583 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DENRO43583 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DENRO43583 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DENRO43583 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DENRO43583 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DENRO43583 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DENRO43583 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DENRO43583 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DENRO43583 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DENRO43583 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DENRO43583 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DENRO43583 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DENRO43583 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms