Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD51CO43502 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms