Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms