Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DYNC1LI2O43237 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI2O43237 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms