Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM6BO15054 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM6BO15054 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
KDM6BO15054 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.77■■■■□ 3
KDM6BO15054 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM6BO15054 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM6BO15054 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM6BO15054 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM6BO15054 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM6BO15054 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM6BO15054 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM6BO15054 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms