Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOCS3O14543 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms