Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ELL2O00472 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ELL2O00472 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ELL2O00472 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELL2O00472 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ELL2O00472 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELL2O00472 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELL2O00472 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ELL2O00472 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ELL2O00472 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ELL2O00472 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ELL2O00472 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ELL2O00472 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ELL2O00472 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ELL2O00472 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ELL2O00472 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms