Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
O00370 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
O00370 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
O00370 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
O00370 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
O00370 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
O00370 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
O00370 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms