Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAPO00193 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAPO00193 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAPO00193 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAPO00193 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAPO00193 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAPO00193 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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