Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3KR12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3KR12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3KR12 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3KR12 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
J3KR12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
J3KR12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3KR12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3KR12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms