Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC188H7C350 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC188H7C350 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC188H7C350 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms