Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMKR1H3BMG3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMKR1H3BMG3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms