Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms