Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP17L11C9JVI0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L11C9JVI0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L11C9JVI0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms