Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGB1P1B2RPK0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMGB1P1B2RPK0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms