Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD1B0YJ81 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD1B0YJ81 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms