Protein–RNA interactions for Protein: A6NHR8

FAM47DP, Putative protein FAM47D, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47DPA6NHR8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47DPA6NHR8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47DPA6NHR8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms