Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEMP2A6NFY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEMP2A6NFY4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms