Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms