Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL33A6NCF5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL33A6NCF5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms