Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37CA5D8V6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms