Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XIRP2A4UGR9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms