Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME2A4GXA9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME2A4GXA9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms