Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIPSLA2A3N6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIPSLA2A3N6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms