Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F8A0AVK6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F8A0AVK6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms