Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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