Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWB2

TRBV7-9, T-cell receptor beta variable 7-9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV7-9A0A0J9YWB2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms